Hoechst染色:hoechst可以穿過活細胞膜與細胞核結合(主要為凋亡活細胞)在紫外光下將核染為藍色.Hoechst染細胞核會影響共聚焦顯微鏡對該樣本其他熒光的觀察效果.hoechst有hoechest33342和hoechst33258兩種hoechsts33258， hoechst33342二者區別不大，但是hoechst33342對細胞的毒性作用更小一些，所以-般來說hoechsts33258用于細胞固定后再染色，而hoechst33342則可以對活細胞直接進行染色!
PI (Propidium Iodide 碘化丙啶)染色:是一種可對DNA染色的細胞核染色試劑，常用于細胞凋亡檢測.碘化丙啶(Propidium Iodide, PD是- -種核酸染料(紅色)，它不能透過完整的細胞膜，但調亡中晚期的細胞和壞死細胞由于細胞膜通透性的增加，PI能夠透過細胞膜而使細胞核染紅.用PI單一染色觀測培養細胞, 只能表示細胞的壞死情況，而不是凋亡( 當然晚期凋亡PI亦可著色)。但是如果您只是想知道細胞的死亡情況，而不是仔細區分壞死或凋亡，那么PI單一染色也可以。但是如果您一定要認定細胞的調亡，那么PI單一染色顯然不夠!
annexin-V染(ran)色(se)細(xi)(xi)(xi)胞凋亡(wang)早期(qi),細(xi)(xi)(xi)胞膜標(biao)志發生(sheng)(sheng)改(gai)變其(qi)中(zhong),磷脂酰絲(si)氨酸(suan)(Annexin-V,PS)外翻,Annexin-V 在Ca+存(cun)在的條(tiao)件下與其(qi)高親和力特異性(xing)結合.這樣,Annexin-v染(ran)色(se)陽性(xing),表(biao)示細(xi)(xi)(xi)胞處于早期(qi)凋亡(wang)狀態.Annexin-V結合不同的熒(ying)光(guang)抗體,就可以利用(yong)(yong)流式細(xi)(xi)(xi)胞儀、熒(ying)光(guang)顯(xian)微鏡以及共(gong)聚焦激光(guang)掃描顯(xian)微鏡檢測細(xi)(xi)(xi)胞凋亡(wang)的發生(sheng)(sheng)。Annexin V用(yong)(yong)FITC標(biao)記發綠色(se)熒(ying)光(guang);如果用(yong)(yong)PE標(biao)記就發紅色(se)熒(ying)光(guang)。